DDoSで集まったトラフィックをCloudFrontで受けた場合でも、直接的な費用節約方法はありません。
Cloudfrontの課金対象になるデータ転送を発生させないようにAWS WAFなどで応答する必要の無いアクセスをブロックすることで費用を節約することが可能です。